Кафедра системного программирования создана 1 августа 2004 г. (приказ ректора No. 75 от 22.07.2004) в составе механико-математического факультета. С 7 февраля 2011 г. в составе факультета Вычислительной математики и информатики. С 1 июля 2016 г. в составе Высшей школы электроники и компьютерных наук. С августа 2025 года в составе Института естественных и точных наук.

Кафедра осуществляет подготовку бакалавров по направлениям 02.03.02 "Фундаментальная информатика и информационные технологии" и 09.03.04 "Программная инженерия" и магистров по направлению 02.04.02 "Фундаментальная информатика и информационные технологии".

На кафедре имеется аспирантура по специальности 05.13.11 "Математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей".

Основные направления научных исследований:
• нейронные сети и глубокое машинное обучение
• технологии обработки больших данных
• интеллектуальный анализ данных
• параллельные вычисления и суперкомпьютерные технологии
• облачные технологии

Материально-техническая база кафедры

В оперативном управлении кафедры находятся следующие помещения, используемые в обучении студентов:
- 2 компьютерных класса, оборудованные интерактивной доской и мультимедийными проекторами, в которых установлены 36 рабочих станций, объединенных в локальную сеть с возможностью постоянного доступа в Интернет;
- 3 аудитории  ПВК ("Персональный виртуальный компьютер"), оборудованные точкой доступа WiFi и розетками для подключения ноутбуков студентов.

В рамках учебного процесса по дисциплинам, связанным с изучением параллельного программирования и суперкомпьютерных технологий, студенты получают доступ к суперкомпьютерам Лаборатории суперкомпьютерного моделирования ЮУрГУ.

Преподаватели кафедры проводят лекционные занятия с использованием мультимедийных проекторов.